За 20 лет до начала истории астероид, направлявшийся на Землю, разрушает Плутон. Позднее этот астероид назовут Танатос. Из-за столкновения с Плутоном астероид был приостановлен. Так или иначе, чтобы избежать разрушения Земли, организация МАИСС (Международное Агентство Изучения Солнечной Системы) работает над проектом «Д» и, после нахождения яйца дракона в глубинах океана, создает Драгонавт. Основная цель этого оружия состоит в том, чтобы разрушить Танатос. Однако и пилоты, и ученые скоро узнают, что астероид — далеко не единственная угроза: Землю начинают наполнять неизвестные существа. Юный Дзин Камисина, герой аниме «Драгонавт: Резонанс» и ученик астрономической школы, отправляется в свой первый полет на Луну. Пилотировать шаттл будет его отец, капитан Камисина, вместе с Дзином летят его мама и сестренка Ай. Ничего не предвещало несчастья – был самый обычный день и самый обычный рейс, но при взлете произошло крушение шаттла. По невероятной случайности Дзин выжил… и жил, как во сне, следующие два года: одинокий, опустошенный, никому не нужный (кроме досужих искателей сенсаций), с мыслями о преступной ошибке отца. Спустя два года Дзин узнает о том, что их шаттл был сбит инопланетянином, а также о существовании суперзасекреченного правительственного проекта «Д». На секретной базе готовится отряд «драгонавтов»: сверхсолдат, прошедших «резонанс» с меха-драконом. «В миру» дракон имеет человеческую внешность, однако по приказу хозяина принимает свое истинное обличье. Яркие футуристические костюмы, невообразимые бюсты драконесс и ученых женщин, яростные меха-сватки над прибрежными бульварами и волнующая специфика таинственного «резонанса» человека и его дракона — всё это в меха-драме от Gonzo!